CentOS 6

cp /etc/localtime /root/old.timezone
rm /etc/localtime
ln -s /usr/share/zoneinfo/Europe/Moscow /etc/localtime

Обновление часовых поясов

yum install tzdata

В интерактивном режиме

tzselect

PHP

Выберите необходимую зону из списка поддерживаемых временных зон и внесите изменения в файл php.ini

[Date]
date.timezone = Europe/Moscow